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OmniDiskSweeperをアプリケーションフォルダから実行すると、ユーザーのドキュメントフォルダがドライブ上で最大のフォルダであることが分かります。また、Spotlightデータベースのサイズが0バイトであることにも注意してください。
Joe氏によると、上記のように通常通り実行すると、OmniDiskSweeperは実行したユーザーが閲覧可能なファイルのみを表示するとのことです。完全な権限を持つ「root」ユーザーとして実行する人はほとんどいないため、システムレベルのファイルや、そのMac上の他のユーザーアカウントに属するファイルやフォルダなど、何かを見落とす可能性が高くなります。
OmniDiskSweeperにドライブ上のすべてのファイルへのフルアクセスを許可するには、ターミナルから sudo コマンドを使用してアプリケーションを実行する必要があります。このコマンドは「Super User Do」の略で、ユーザーのドライブ上のすべてのファイルへのアクセスを許可します。他の sudo コマンドと同様に、実行する前に構文を必ず確認してください(または、ここからコピー&ペーストしてください)。誤ったコマンドを入力すると、OSとファイルシステムに回復不能な損傷を与える可能性があります。OmniDiskSweeperがメインのアプリケーションフォルダにインストールされている場合、このコマンドは以下のようになります。
sudo /Applications/OmniDiskSweeper.app/Contents/MacOS/OmniDiskSweeper
管理者パスワードを入力すると、アプリケーションが起動し、ドライブ内の すべての ファイルをスキャンできるようになります。以下で、以前は空だった.Spotlight-V100フォルダに、800MBを超えるコンテンツが表示されていることに注目してください。

OmniDiskSweeperをターミナルからroot権限で実行します。Spotlightデータベースのサイズを前のスクリーンショットと比較してください。root権限で実行すると、アプリケーションはこの場所だけでなく、ドライブ上の他の場所にアクセスし、サイズを変更できます。
素晴らしいヒントをありがとう、ジョー!