macOS Sierraのリリース前夜、富士通はScanSnapスキャナのユーザーに対し、OSのPDF処理に問題があり、スキャンした文書のデータ損失につながる可能性があるという警告を発しました。SierraにおけるPDFデータ損失のリスクは当初懸念されていたほどではないことが判明しましたが、富士通の互換性に関する警告は、Appleの最新MacオペレーティングシステムにおけるPDF関連の問題の始まりに過ぎず、最近のmacOS Sierra 10.12.2アップデートでさらに悪化しているようです。

SierraのPDFバグ:iOSのせい
TidBITS発行者の Adam Engst が指摘しているように 、Apple が macOS と iOS の間で PDF の表示と編集のための共通基盤を構築しようとしたことで、Sierra で多くの問題が発生し、サードパーティ ソフトウェアの開発者は、データ損失のリスクを最小限に抑えるために、ユーザーに Apple 独自のプレビュー アプリの使用を避けるよう推奨するまでになっています。
ベテラン Mac アプリ DEVONthink の主任開発者 Christian Grunenberg 氏によると、この問題は Apple が書き換えた PDFKit API を時期尚早にリリースしたことに起因しており、このリリースによって既存の機能の一部が削除され、他の機能との互換性が損なわれたため、さまざまなサードパーティ製アプリで問題が発生したとのことです。
AppleはiOSとmacOSで共通の基盤を使いたいと考えています。しかし、リリースがあまりにも早すぎたため、Appleは初めて(少なくとも私の経験では)互換性を顧みずに複数の機能を廃止しました。さらに悪いことに、以前の機能の多くが動作しなくなったり、全く実装されなくなったりしています。そのため、多くの回避策を追加したり、独自に実装したりする必要がありました。そして、まだやるべきことが残っています。
「ずさんなコードと無関心」
Sierra の PDF 問題は同オペレーティングシステムの発売当初から存在していたが、ユーザーと開発者の双方にとって最も気がかりなのは、状況が悪化しているように見えることだ。Bookends 書誌アプリの開発者である Jon Ashwell 氏は、macOS Sierra 10.12.2 は PDF 互換性の点で「ひどい」もので、ユーザーが注釈付きの PDF を開くたびにクラッシュを引き起こすと報告している。Ashwell 氏と他の開発者たちは、バグレポートやその他の情報を提出して Apple にこの件の解決を試みてきたが、同社はほとんど沈黙を守っていると主張している。「こんなにずさんなコードと Apple の無関心のひどい例は見たことがありません」と Ashwell 氏は TidBITSに語った。
Sierraユーザーの一部にとって比較的朗報なのは、問題がPDFKitに依存するアプリに限定されているように見えることです。Smile SoftwareのPDFPenなど、他のPDFライブラリを使用するアプリは、現時点では影響を受けていないようです。しかし、この一見したところの免除は、ユーザーがPreviewやその他のPDFKit依存アプリを完全に避けている場合にのみ適用されます。ユーザー自身、またはユーザーがPDFファイルを共有する人が、Previewやその他のPDFKitアプリで文書を編集すると、OCRレイヤーの消失や文書自体の破損といった問題が発生する可能性があります。こうした問題への対策として、ユーザーはPDFのコピーを作成し、Previewなどのアプリで誤って文書を編集した場合でも元の文書が確実に保存されるようにする必要があります。
次の Sierra アップデート 10.12.3 は現在テスト中ですが、Apple がこれらの問題を修正したという確認はまだありません。